在2006年以前的23年时间里，重庆公司主要从事测绘及勘探工作，经历了由小到大的发展历程，完成的实物工作量和清算收入逐年增长，年产值由1983年的8.3万元增加到2005年的近5000万元。先后承担了宝成电气化铁路增建二线、成昆铁路电气化改造、南昆铁路、川黔铁路电气化改造、襄渝铁路增建二线、达成铁路、内昆铁路、渝怀铁路、达万铁路、遂渝铁路、郑西客运专线、武广客运专线、成渝高速公路、重庆机场快速路、彭水至武隆高速公路、达渝高速公路、重庆快速路一横线歇马隧道、深圳地铁三号线、昆明轨道交通三号线等重点铁路、公路、市政、地铁、轻轨的勘察和设计任务，在中铁二院改革发展的辉煌史册上，写下了中铁二院重庆公司增光添彩的一页。
2007年，中铁二院完成公司改制挂牌后，中铁二院重庆公司被赋予了新的历史使命，主营业务由勘察转型为设计咨询，由此步入了一个新的发展历程。面对新的形势，公司领导班子瞄准市场，科学决策，制定了“把中铁二院重庆公司打造成为具有核心竞争力、综合实力一流的设计咨询企业”的发展战略和长远规划。
中铁二院重庆公司人在时代的感召下，“齐心协力谋发展，众志成城求跨越”，破难关，攻险阻，秉承成昆精神，不断攀向高峰，获得累累硕果。
转型以来的三年时间里，中铁二院重庆公司作为主体设计单位独立承担了近2000公里的铁路长大干线和铁路专用线的设计任务，承担了大量的城市轨道交通、公路、市政、地质灾害防治等工程的设计、评估和咨询。
（铁路工程）
南川至涪陵铁路是转型后作为主体设计单位独立承担的第一个铁路项目;
渝怀铁路增建二线工程全线600公里的设计任务，是转型后作为主体设计单位独立承担的第一个长大干线铁路。该项目渝涪段可行性研究荣获重庆市2010年优秀工程咨询成果一等奖。
重庆至万州铁路客运专线是转型后作为主体设计单位独立承担的第一个高速铁路项目。
三江至南川铁路为既有线扩能改造，是转型后作为勘察、设计主体单位独立承担并真正实现勘察设计一体化的铁路项目。
转型后作为主体设计单位还独立承担了兰渝铁路南充东至高兴段、叙永至大村地方铁路等。
（公路工程）
独立承担的遂渝高速公路高滩岩至土主段于2007年12月29日正式通车运营，其中的大学城隧道设计，荣获四川省2008年度工程勘察设计“四优”二等奖。
（城市轨道交通工程）
参与设计的重庆市轨道交通二号线较场口至新山村线一期工程是国家西部大开发十大重点工程之一，该项目获2005年全国十大建设科技成就奖，被建设部列为2007年全国建设行业城市轨道交通专项科技成果推广项目。
参与设计的重庆市轨道交通三号线二期工程龙头寺至江北机场段项目已于2009年2月陆续动工，该项目隧道设计QC小组被命名为2010年全国优秀质量管理小组。
（市政工程）
承担设计和部分施工的重庆市南滨路是重庆市一张亮丽的名片，被喻为重庆第一路；
独立完成全过程勘察、设计的重庆市城市快速干道陈庹路为重庆市市级重点工程；其中的双山隧道和羊子岩隧道为单向三车道，是当时西南地区跨径最大的隧道。
主持设计的重庆双碑隧道全长4373米，是目前国内市政工程规划建设的最长的市政隧道，于2010年7月6日开工建设。
重庆公司还独立承担了重庆沙坪坝火车站换乘枢纽综合改造工程的方案设计、重庆北碚十里温泉城运河核心片区市政景观道路工程 设计等。
（地质灾害防治工程）
地质灾害防治工程，一直是中铁二院重庆公司的王牌。随着三峡工程建设的不断推进，国家对三峡库区地质灾害防治十分重视。重庆公司以雄厚的技术实力和良好的业绩，参与了三峡库区重庆市第一期、第二期地质灾害防治工作。受重庆市国土局委托，重庆公司还担任了三峡库区重庆市第三期地质灾害防治工程的技术顾问单位。在地灾防治工作中，云阳张飞庙滑坡抢险治理工程的设计是其中的亮点。2008年1月8日，中共中央政治局委员、重庆市委书记薄熙曾亲临张飞庙滑坡抢险治理工程工地视察，听取了重庆公司对该滑坡治理工程的情况汇报。
（工程总承包）
一花独放不是春，百花齐放春满园。在努力做好主业的同时，重庆公司还积极拓宽业务范围，延伸业务领域，由其承担的中国铝业水江铁路（企业）专用线EPC项目已于2009年9月16日开工建设。
（海外项目）
在立足国内的同时，中铁二院重庆公司还积极走向海外，迈出了可喜一步。2009年11月，承担了格鲁吉亚第比利斯绕城铁路咨询工作；并于 2010年5月，与国内一家企业联合投标，成功获得该项目的设计施工总承包合同。
重庆公司还派出技术骨干参与了阿尔及利亚BBA至Thenia铁路的设计。
岁月见证发展。在短短三年间，中铁二院重庆公司干部职工靠着坚忍不拔的毅力，脚踏实地，埋头苦干，完成了历史性跨越，成功实现了转型，经济效益强劲增长，技术水平快速提升，设计能力大幅提高，综合实力显著增强。
